DeepMind/Google

Google prezintă AlphaFold 3, noua iterație a modelului AI care a prezis structurile a sute de milioane de proteine4 min read

De Ionuț Preda 13.05.2024

AI-ul Google care prezice structurile proteinelor poate fi acum folosit pentru a modela molecule de ARN, ADN și multe tipuri de interacțiuni biomoleculare

O echipă mixtă de cercetători medicali și specialiști în AI, de la proiectul DeepMind al celor de la Google și compania Isomorphic Labs din Londra, a anunțat, printr-un studiu publicat în Nature,//„Accurate structure prediction of biomolecular interactions with AlphaFold 3”, nature.com // o nouă iterație a modelului AlphaFold, un sistem AI bazat pe deep learning care poate face predicții pentru diverse structuri biomoleculare.

Dacă primele două versiuni de AlphaFold au fost folosite pentru a obține predicții legate de structura proteinelor, AlphaFold 3 a fost antrenat pentru a face predicții asupra unei game largi de structuri biomoleculare, incluzând structuri de tip ADN și ARN, dar și molecule de dimensiuni mai mici, precum anticorpi sau liganzi.//„AlphaFold 3 predicts the structure and interactions of all of life’s molecules”, blog.google.com //

Cu aceste noi abilități, AlphaFold 3 poate efectua predicții pentru diverse interacțiuni care au loc în urma administrării unui medicament, precum modul în care anticorpii se leagă de proteinele țintite. Astfel, sistemul va putea fi utilizat, pentru prima dată, în dezvoltarea de noi terapii pe bază de anticorpi monoclonali. Autorii studiului susțin și că predicțiile obținute cu AlphaFold 3 au un nivel de acuratețe semnificativ mai ridicat decât precedenta iterație.

Totodată, Google DeepMind a lansat în regim beta și AlphaFold Server// Disponibil pe sandbox.google.com // – un serviciu web gratuit, bazat pe AlphaFold 3, care poate fi folosit în cercetarea noncomercială pentru a genera predicții și a modela structuri de proteine, ADN, ARN, liganzi, ioni și modificări chimice. Google DeepMind menține, în prezent, o bază de date cu acces deschis cu cele peste 200 de milioane de predicții de structuri de proteine realizate cu AlphaFold.// Disponibilă pe alphafold.ebi.ac.uk //

A doua iterație de AlphaFold, lansată în 2020, a devenit un instrument cheie pentru mulți biologi moleculari, care în trecut aveau nevoie de luni sau chiar ani pentru a obține o predicție precisă a structurii unei singure proteine. Cunoașterea structurii poate releva funcții încă necunoscute ale proteinelor, cu potențiale efecte în tratamente pentru diferite boli. De altfel, AlphaFold 2 a fost folosit, printre altele, pentru a accelera cercetări privind vaccinurile antimalarie,//„Our malaria vaccine work highlighted by AlphaFold”, web.ox.ac // tratamente pentru cancer//„Researchers use AI-powered database to design potential cancer drug in 30 days”, utoronto.ca //  sau crearea de noi enzime.// „AlphaFold2 and Deep Learning for Elucidating Enzyme Conformational Flexibility and Its Application for Design”, acs.org //

 



Text de

Ionuț Preda

Redactor cu câțiva ani de experiență în presa centrală. Este curios despre aplicarea tehnologiilor SF în lumea reală și evoluția ideilor de-a lungul istoriei.

SĂNĂTATE|FYI

A fost descoperită regiunea din creier care provoacă paranoia

De
Cercetătorii de la Yale au legat anumite regiuni ale creierului de paranoia, printr-un nou studiu. Rezultatele ar putea conduce către tratamente mai sigure. 
ȘTIINȚĂ|FYI

Cutremurele majore ar putea fi detectate cu până la 19 zile în avans, prin date de satelit

De
Un studiu de caz bazat pe date de satelit din regiunea cutremurului de 7,8 care a avut loc în Turcia și Siria în 2023 ar putea deschide calea pentru avertizări foarte timpurii ale seismelor majore.
ȘTIINȚĂ|PORTRET DE CERCETĂTOR

Laura Bouriaud, cercetătoarea în silvicultură care a așezat Suceava pe harta cercetării internaționale

De
Cercetarea silvică de la Suceava este cunoscută internațional datorită Laurei Bouriaud, care a atras, în ultimii 15 ani, 1,8 milioane de euro pentru proiecte în care i-a implicat pe studenții ei doctoranzi. Își propune să-i formeze cu o atitudine morală față de cercetare, pentru că aceasta va duce la o gestionare durabilă a pădurilor. 
MEDIU|FYI

Războiul Rusiei în Ucraina accelerează criza climatică

De
Numai în primii doi ani, costul climatic al războiului provocat de ruși în Ucraina depășește emisiile anuale cumulate generate de 175 de țări, se arată într-un nou raport.